Os órgãos reprodutores masculinos externos homem são o escroto e o pénis. Como órgãos internos o homem possui as gónadas, que produzem os gâmetas e hormonas, as glândulas acessórias, que secretam produtos essenciais para o movimento dos gâmetas, e as vias genitais, nas quais circulam os gâmetas e as secreções glandulares.
As gónadas masculinas denominam-se testículos e os gâmetas, por elas produzidas, designam-se espermatozóides. Os homens possuem dois testículos, cada um um deles constituído por numerosos tubos seminíferos enrolados, rodeados por várias camadas de tecido conjuntivo, a túnica albugínea ou cápsula fibrosa, que dá origem a vários septos, dividindo os testículos em vários lóbulos. Cada lóbulo testicular contém dois ou três tubos seminíferos enovelados, nos quais ocorre a produção de espermatozóides. Os tubos seminíferos convergem para a zona posterior dos testículos formando a rede testicular, de onde saem cerca de quinze canais que se vão ligar ao epidídimo.
A nível histológico, é possível distinguir, no epitélio dos tubos seminíferos, grandes células somáticas, chamadas células de Sertoli, que desempenham uma função bastante importante no processo de espermatogénese. Entre os tubos seminíferos, distinguem-se células intersticiais de grande tamanho, designadas células de Leydig, que produzem, entre várias hormonas, a testosterona, responsável pelo aparecimento dos caracteres sexuais secundários do homem.
Os epidídimos são dois, um em cada testículo. Cada um deles é composto por um tubo muito enrolado, que comunica com o respetivo canal deferente. A passagem de esperma pelo epidídimo dura cerca de vinte dias, ao longo dos quais os espermatozóides vão amadurecendo, ganhando mobilidade e capacidade fecundativa. Os canais deferentes partem do escroto e rodeiam a bexiga urinária, atrás da qual cada um deles se une a um canal da vesícula seminal, formando um curto canal ejaculatório. Durante a ejaculação, o esperma passa através dos canais deferentes graças à contração das paredes musculosas destes ductos. Ambos os canais ejaculatórios abrem para a uretra, canal comum ao aparelho reprodutor e ao aparelho urinário, que comunica com o exterior, na extremidade do pénis.
As glândulas acessórias do aparelho reprodutor masculino são as vesículas seminais, a próstata e as glândulas de Cowper.
As duas vesículas seminais produzem um líquido alcalino, que contribui com cerca de 60% do volume total do esperma e, contém muco, frutose, enzimas e hormonas.
A próstata é a maior glândula acessória e secreta, diretamente para a uretra, vários produtos, entre os quais citrato e enzimas anticoagulantes. A próstata permite também a passagem para a uretra de urina, proveniente da bexiga urinária, controlando assim, a alternância da passagem de produtos provenientes do aparelho urinário e do aparelho reprodutor.
As duas glândulas de Cowper situam-se abaixo da próstata. Antes da ejaculação, estas glândulas secretam para a uretra um muco alcalino, neutralizando a acidez da urina que, eventualmente, possa aí permanecer.
O escroto é um prega externa da superfície corporal que permite manter os testículos fora da cavidade abdominal. Este fato, reveste-se de uma grande importância, pois, na maioria dos mamíferos a produção de esperma não ocorre à temperatura corporal. A temperatura do escroto é cerca de 2ºC mais baixa que a temperatura do corpo, sendo, por isso, ideal para a espermatogénese.
O pénis é constituído por três cilindros de tecido esponjoso eréctil, os designados corpos cavernosos, resultantes da modificação de veias e capilares sanguíneos. Durante o ato sexual, os corpos cavernosos enchem-se de sangue proveniente das artérias do pénis. O seu enchimento causa um aumento de pressão que provoca o fecho das veias do pénis, permitindo, assim, a erecção. A erecção é essencial para a inserção do pénis na vagina, de forma a depositar aí o sémen, líquido resultante da ejaculação. Na extremidade do pénis, situa-se a glande, rica em terminações nervosas, que apresenta no seu vértice o meato urinário, no qual se abre a uretra. A glande é recoberta por uma prega de pele denominada prepúcio.