O Incidente de Fachoda deu-se na cidade com o mesmo nome, no que corresponde actualmente ao Sudão do Sul, foi um incidente diplomático envolvendo as duas maiores potências colonizadores de África, França e Reino Unido, em 1898 e 1899.
A Conferência de Berlim de 1884-85 tentou pela via diplomática, solucionar a questão africana e a disputa pelos seus territórios pelas diversas potências europeias. Mas a criação de linhas férreas, aproveitamento de recursos económicos e rotas comerciais, levou a um contínuo choque entre as potências.
Tanto os franceses como os britânicos pretendiam construir um caminho-de-ferro que ligasse as suas colónias, mas estes projectos sobrepunham-se. Aliando estas pretensões, com a não-aceitação franca da ocupação do Egipto pelos britânicos, deu-se a incursão militar franca no Sudão que resultou no Incidente de Fachoda.
Militarmente o Reino Unido era superior à França, e a França necessitava do apoio britânico contra a Alemanha. Mediante este contexto adverso para a França, os franceses acabaram por reconhecer a legitimidade da soberania inglesa no Egipto e assinar um acordo de aliança com o Império Britânico, por seu lado, os ingleses concordaram com a soberania franca em Marrocos.
O Incidente de Fachoda marcou o último incidente entre França e Reino Unido, por razões coloniais, e incentivou a Aliança contra o Império Alemão – Tríplice Entente. Os rios Nilo e Congo passaram a demarcar as zonas de influência franca e inglesa.
