Marcadores moleculares são caraterísticas de DNA que diferenciam dois ou mais indivíduos e são herdadas geneticamente. Estas sequências de DNA revelam polimorfismos entre indivíduos geneticamente relacionados.
Marcadores de DNA são comummente utilizados para o mapeamento genético.
Seguem alguns exemplos de diferentes tipos de marcadores moleculares recorrentemente utilizados em engenharia genética:
- Polimorfismos de fragmentos de restrição (restriction fragment length polymorphism, RFLPs);
A análise de polimorfismos de locais de restrição (RFLPs) baseia-se na diferença de tamanho de fragmentos de restrição de DNA específicos. Esta análise, pode ser realizada através da técnica de Southern Blot ou PCR (Polymerase Chain Reaction).
- Polimorfismos de sequências repetitivas (simple sequence length polymorphism, SSLP);
– Minisatélites: Unidade repetitiva até 25 pb, por ex. (ATGTCACGTAGCATCACTGCGA)n
– Microsatélites: Unidade repetitiva até 13 pb, por ex. (ATG)n
SSLPs podem ser detetados por eletroforese em gel de agarose ou por eletroforese capilar, após a realização da técnica de PCR (Polymerase Chain Reaction).
- Polimorfismos nucleotídicos (single nucleotide polymorphism, SNP)
SNPs originam em locais de mutações pontuais. Em eucariontes, em média, ocorre 1 SNP em cada 10 000 pb
