Conceito de RNA Polimerase
A RNA polimerase é uma enzima que catalisa a síntese de RNA a partir de um molde de DNA. A RNA polimerase desenrola a hélice dupla de DNA e inicia a síntese de RNA. A síntese da nova cadeia de RNA decorre na direção 5’ → 3’, isto é, a RNA polimerase inicia a síntese de RNA na extremidade 5’ da molécula de RNA a ser sintetizada e continua a acrescentar nucleótidos à extremidade 3’da cadeia de RNA até estar estar completa. A síntese da cadeia de RNA termina quando a RNA polimerase reconhece uma sequência de DNA específica, conduzindo à separação da RNA polimerase da cadeia molde de DNA e da cadeia de RNA recém sintetizada.
Nas bactérias, a mesma RNA polimerase é responsável pela síntese de quase todos os tipos de RNA, incluindo as moléculas de RNA mensageiro (mRNA), de RNA ribossómico (rRNA) e de RNA de transferência (tRNA). A RNA polimerase bacteriana é constituída pelo centro catalítico de cinco subunidades chamadas α, β, β’, ω, sendo que aparecem 2 subunidades α idênticas. Existe uma subunidade adicional e que não está sempre presente na RNA polimerase bacteriana e é chamada de factor σ. Quando todas as subunidades se juntam, forma-se a holoenzima (α2ββ’ωσ) e na ausência do factor sigma designa-se a RNA polimerase bacteriana apenas pelo nome centro catalítico (α2ββ’ω). O centro catalítico catalisa a síntese de RNA a partir de uma cadeia molde de DNA mas necessita do factor σ para iniciar a transcrição, sendo libertado de seguida.
Nas células dos organismos eucariotas existem três tipos de RNA polimerase que se diferenciam sobretudo pelo tipo de RNA que sintetizam:
a) a RNA polimerase I catalisa a síntese de moléculas de rRNA;
b) a RNA polimerase II catalisa a síntese de mRNA;
c) e a RNA polimerase III catalisa a síntese de pequenas moléculas de RNA, como os tRNA.
As RNA polimerases dos eucariotas são constituídas por cerca de 12 subunidades, formando um grande agregado proteíco superior a 500 kDa. As atividade enzimáticas de cada tipo de RNA polimerase podem ser distinguidas na prática pela sua sensibilidade à presença de algumas moléculas como a α-amanitina e a actinomicina D. A RNA polimerase I não é inibida na presença de α-amanitina mas é na presença de actinomicina D. Já a RNA polimerase II é rapidamente inibida em presença de baixa concentrações de α-amanitina mas é pouco afetada pela presença de actinomicina D. Nas células animais, a RNA polimerase III é inibida na presença de concentrações elevadas de α-amanitina e é pouco sensível à actinomicina D.